在封测期间《潘朵拉的回响》的游戏一共开放了五种不同的游戏模式，个人有玩到的模式目前有五种，在以下会做一个简单的介绍。
【战役】
为此游戏的主要剧情内容，分为剧情关卡及训练关卡，有普通及困难难度，还有一个每章过关后的防御计画，另外还有一个额外的隐藏关卡，需要透过各个剧情关卡中收集隐藏钥匙来解锁。
【资源战】
分为4种类别，刷钱、提升技能的素材、升级所需EXP素材、装备箱，每天各个关卡可以打两次，此为重要的资源来源，每天都要打~
【演习】
采用赛季制，每个赛季15天一个循环，战斗过程为自动战斗，会自动释放技能、支援技能、变换阵行，战斗胜利可获得积分，失败也不会扣除积分，但是不管胜利或失败皆可获得荣誉值，另外每次突破之前的赛季最高段位，会获得一次突破奖励，每天可以免费刷新对手5次，消耗石头可继续刷新3次，挑战回数上限为10次，90分钟回复一次。
【潜脑作战】
此模式用来获得支援兵的模组装备，有表里两种难度，另外过关会获得积分及模组采购许可，可以与其他人进行排名比较，排名越高会有越好的奖励。
【逆向空间】
似乎是赛季，没玩过不是很清楚。
